Les amphibiens se déplacent entre différents habitats au cours de l’année, notamment entre leurs sites de reproduction, leurs zones d’estivage et leurs quartiers d’hivernage. Lorsque ces routes migratoires sont coupées par une infrastructure ferroviaire, de nombreux individus peuvent être écrasés. Ces infrastructures peuvent également constituer de véritables barrières, empêchant les animaux d’atteindre leurs habitats saisonniers. Afin de répondre à cette problématique, 400 sites de conflits potentiels entre amphibiens et les voies ferrées appartenant aux CFF ont été identifiés à l’échelle nationale, grâce à une méthodologie spécifique (FerFrog) d’évaluation et d’assainissement développée par info fauna  karch, sur mandat de l’Office fédéral de l’environnement (OFEV).

Le bureau Biotec a été sollicité afin d’évaluer en 2024 les 11 sites de conflits situés dans le canton du Jura. Une phase de priorisation a permis d’identifier deux tronçons particulièrement sensibles, situés à Courtemaîche (commune de Basse-Allaine) et à Courgenay.

Ces deux sites ont fait l’objet d’investigations de terrain détaillées au cours de l’année 2025, selon la méthodologie Fer Frog. Ce travail a permis de produire des fiches détaillées par site, comprenant une description complète, la cartographie des obstacles et des axes de migration, une documentation photographique ainsi que des propositions concrètes de mesures d’assainissement.

Les résultats ont mis en évidence une mortalité importante d’amphibiens sur les deux tronçons étudiés, avec un nombre d’individus écrasés particulièrement élevé en comparaison avec d’autres sites analysés à l’échelle nationale. Ce constat a souligné le caractère prioritaire de ces secteurs et la nécessité d’intervenir rapidement.

Sur la base de ces résultats, les CFF ont réagi très rapidement en mettant en œuvre des mesures concrètes en fin d’année 2025. Des déflecteurs ont ainsi été installés le long des voies afin de canaliser les déplacements des amphibiens, de réduire significativement le risque de collision et de permettre une liaison possible entre le site d’hibernage et le site de reproduction.

Maitre d’ouvrage : info fauna – karch et SBB CFF FFS