Les installations du SEDE à Courroux, exposées à un danger moyen d’inondation, ont fait l’objet de travaux de protection contre une crue tricentennale de 375 m³/s, incluant digues, murs et élargissement du lit de la Birse. Ces aménagements, situés principalement en rive gauche sur la commune de Soyhières, sont combinés à des mesures de revitalisation favorisant la faune et la stabilité des berges.